Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms