Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms