Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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