Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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