Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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