Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms