Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1NQ9UHG2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms