Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms