Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms