Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms