Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms