Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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