Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BCO2Q9BYV7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCO2Q9BYV7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms