Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms