Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC8Q9BY41 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms