Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms