Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms