Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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