Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms