Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms