Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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