Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TIMM29Q9BSF4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms