Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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C2orf48Q96LS8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf48Q96LS8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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