Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms