Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD2Q96C19 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms