Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG4Q92954 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms