Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms