Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms