Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDCSPQ8NFU4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms