Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms