Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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