Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM25Q86YD3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms