Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms