Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms