Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms