Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms