Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms