Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms