Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SLX4IPQ5VYV7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLX4IPQ5VYV7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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