Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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