Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARHGAP40Q5TG30 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms