Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms