Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXO48Q5FWF7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms