Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms