Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms