Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RNF212Q495C1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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