Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms