Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms