Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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COL24A1Q17RW2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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COL24A1Q17RW2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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COL24A1Q17RW2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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