Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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